Özel ayırma projelerinde, su arıtma membran teknolojisi esas olarak biyofarmasötiklerde malzeme konsantrasyonu, boya atıksu arıtımı ve protein ayrımı için kullanılmaktadır. Nanofiltrasyon membranı ve elektrodiyaliz teknolojileri, bu alanlarda seçici ayırmada rol oynamaktadır; örneğin moleküler ağırlık farkı olan maddelerin ayrılması için nanofiltrasyon ve asit ve alkali geri kazanımı ile başa çıkmak için elektrodiyaliz. Biyofarmasötiklerde aşağı yönlü saflaştırma, ürünün saflığını ve güvenliğini sağlamak amacıyla virüsleri veya hücresel kalıntıları uzaklaştırmak için ultrafiltrasyon ve mikrofiltrasyon gerektirir.